無菌室大小應能夠滿足檢驗工作的需求。內墻為淺色，墻面和地面應光滑，墻壁與地面、天花板連接處應呈凹弧形無縫隙，無死角，易于清潔和消毒。
無菌室入口處應設置緩沖間，緩沖間內應安裝非手動式開關的洗手盆，并可有毛巾。緩沖間應有足夠的面積以保證操作人員更換工作服及鞋帽。
無菌室內工作臺的高度約80cm，工作臺應保持水平，工作臺面應無滲漏耐腐蝕易于清潔、消毒。
無菌室內光照應分布均勻，工作臺面的光照度應不低于540lx。
無菌室應具備適當的通風和溫度調節的條件。無菌室的推薦溫度為20 相對濕度為40-60%。
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